流域水環(huán)境綜合治理中存在以下水利科學(xué)問(wèn)題：

（1）流域河流、湖庫、濕地系統宏觀(guān)格局與支撐能力

（2）河流縱橫形態(tài)的生態(tài)影響規律

（3）流域不同尺度河流連通和生態(tài)基流維持

（4）不同水動(dòng)力條件下污染物輸移過(guò)程和生態(tài)效應

（5）流域污染物容量總量控制和科學(xué)增容強凈

（6）水資源生態(tài)配置與節水減污社會(huì )建設

（7）農田溝渠生態(tài)化與生態(tài)型灌區建設

（8）河道硬質(zhì)化的生態(tài)效應及改進(jìn)和修復技術(shù)

（9）防洪堤壩安全穩定與生態(tài)化協(xié)同技術(shù)

（10）水利工程與生態(tài)工程協(xié)同建設、運行和管理

（11）河流水生植物修復對行洪能力影響規律及對策

（12）調水引流和水力調控的科學(xué)原理與生態(tài)風(fēng)險

流域水環(huán)境綜合治理的是我國水利發(fā)展的迫切需求，水利部門(mén)在流域水環(huán)境綜合治理中具有重要地位，應肩負起流域水環(huán)境綜合治理的主要責任，在認真研究和回答流域水環(huán)境綜合治理中存在的基本水利科學(xué)問(wèn)題的基礎上，科學(xué)進(jìn)行流域水系和水環(huán)境綜合治理規劃，合理構建流域水環(huán)境綜合治理的技術(shù)體系，為改善流域水環(huán)境、保障社會(huì )經(jīng)濟可持續發(fā)展發(fā)揮出重要作用。